Molekulardynamik-Simulationen von mechanisch und thermodynamisch induzierter Kinetik supramolekularer Konformationsänderungen

Ken Alexander Schäfer
In der vorliegenden Dissertation werden zwei Arten supramolekularer Konformationsänderungen mittels Molekulardynamik-Simulationen untersucht. Im ersten Teil der Arbeit wird der reversible Übergang zwischen zwei Zuständen eines Calix[4]aren-Catenans unter verschiedenen Bedingungen studiert. Dabei wird dieses Molekül in FPMD-Simulationen in die offene Konformation gezogen und anschließend die angelegte Kraft auf einen kleinen Wert herabgesenkt. Die beobachtete Relaxation des Moleküls wird im Hinblick auf die Reihenfolge der Wasserstoffbrückenbildung untersucht. Durch die statistische Analyse mehrerer Tausend Trajektorien wird ein kraftabhängiger...
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